איסוף דגימות: ראשית, אסוף את הדגימות הביולוגיות המתאימות לפי תסמינים קליניים ומקורות אפשריים לזיהום. בבדיקות מיקרוביולוגיות של מזון, יש לאסוף דגימות מזון מייצגות לפי השיטות והכמויות שנקבעו. יש להקפיד על עקרון הפעולה האספטית במהלך תהליך האיסוף כדי למנוע זיהום הדגימות.
עיבוד דגימה: הדגימות שנאספו מטופלות מראש כראוי, כגון דילול, ריכוז, הפרדה, הומוגניות, ריסוק וכו', כדי להתאים את עצמם לשיטות הגילוי הבאות. לדוגמה, ייתכן שיהיה צורך לכתוש דגימות בשר במזון, להומוגגיזציה וכו' כדי להבטיח שהמיקרואורגניזמים מפוזרים באופן שווה בתמיסת הדגימה.
בחר מצע תרבית: בחר מצע תרבות סלקטיבי מתאים בהתאם לסוג המיקרואורגניזם שיש לזהות. לדוגמה, בבדיקה מיקרוביולוגית של מזון, מצע תרבית מתאים נבחר בהתאם לסוג המיקרואורגניזם שיש לאתר.
תרבית חיסון: יש לחסן את הדגימה המטופלת לתוך מצע התרבות ולהטפח אותה בתנאי טמפרטורה, לחות וזמן מתאימים. במהלך תהליך התרבית, יש צורך לצפות בצמיחת התרבית, כגון המורפולוגיה, הצבע והשקיפות של החיידקים.
תצפית וספירה במושבות: התבוננו במורפולוגיה, בצבע ובמאפיינים נוספים של המושבות על מצע התרבות לאחר התרבות, וספרו וזיהוים. עבור בדיקת חיידקים במזון, נדרש גם דוח בדיקת חיידקים2.
פרשנות התוצאה: בהתבסס על תוצאות הבדיקה, פרש את התוכן המיקרוביאלי של הדגימה. לבדיקה כמותית, ניתן לחשב אינדיקטורים כגון ספירת מושבות וריכוז חיידקים; לבדיקה איכותית, ניתן לקבוע אם המדגם מכיל מיקרואורגניזם מסוים.
תחומי יישום ספציפיים של ניתוח מיקרוביאלי כוללים:
בדיקת חיידקים במזון: להבטיח בטיחות מזון ומניעת הרעלת מזון ובעיות בריאות אחרות. למשל, לזהות Escherichia coli, סלמונלה וכו' במזון.
בדיקת חיידקים סביבתיים: הערכת היגיינה סביבתית ומניעת העברת מחלות. למשל, לזהות מיקרואורגניזמים באוויר ובמקורות המים של מקומות ציבוריים כמו בתי חולים ובתי ספר.
תחום רפואי: מעקב אחר זיהום מיקרוביאלי של מכשירים רפואיים, תרופות וכו' כדי להבטיח בטיחות רפואית.
באמצעות השלבים והתהליכים לעיל, ניתן להשלים באופן שיטתי ניתוח מיקרוביאלי כדי להבטיח את הדיוק והאמינות של התוצאות.
